Epigenetica2022-04-26T12:01:59+00:00

Epigenetica

Een hersencel doet heel andere dingen dan een levercel. Ook ziet hij er geheel anders uit. Toch is hun DNA identiek binnen één persoon. Tijdens de ontwikkeling in de baarmoeder wordt het DNA chemisch aangepast (DNA methylatie) en met eiwitten opgerold (zogenaamde histonen) in de celkern zodat alle stukken DNA die nodig zijn in een specifiek celtype losjes in deze kern zitten en daardoor snel actief kunnen worden. Stukken die niet of minder vaak nodig zijn worden diep weggestopt in de celkern. Deze mechanismen gezamelijk noemt men epigenetica. Aangenomen wordt dat veranderingen in de epigenetische afstelling deels ten grondslag liggen aan de relatie tussen omstandigheden vroeg in het leven en de gezondheid velen jaren later.

Stukken DNA opsporen

Onze vakgroep heeft zich als doel gesteld de stukken DNA op te sporen die gevoelig zijn voor omgevingsfactoren vroeg in het leven en we proberen hun rol in ziekteprocessen te doorgronden. Hiervoor bestuderen we grote cohort studies. Een van de bekendste onderzoeken die we doen zijn de epigenetische studies aan mensen die in de baarmoeder zaten tijdens de hongerwinter, een ernstige hongersnood aan het eind van de Tweede Wereld oorlog. In 2008 was onze vakgroep de eerste die aantoonde dat dat een kortstondig prenatale omgevingsverandering kan leiden tot levenslange epigenetische veranderingen in mensen. DNA methylatie, een van de epigenetische afstellingsmechanismen, was anders in mensen die verwekt waren tijdens de hongerwinter.

Met vele vervolgstudies met ‘medium- and high-throughput’ technologieën (massa spectrometrie en next generation sequencing) hebben we inmiddels aannemelijk gemaakt dat dit soort epigenetische wijzigingen de verbinding kunnen vormen tussen een aangepast prenatale ontwikkeling en het ziekterisico later in een volwassen individu.

Op het moment doen we meerdere studies op genoom schaal, in verschillende grote populatie studies binnen het LUMC en (inter)nationaal. Voor deze studies ontwikkelen we bio-informatische methodes voor de integratie van genetische, epigenomische en transcriptomische data en in-vitro systemen voor de functionele characterizatie van geïdentificeerde epigenetische aanwijzingen. Door deze integratie hopen we de mechanismes te doorgronden die ten grondslag liggen ouderdomsziekten en ook nieuwe klinisch relevante voorspellers van ziekterisico te ontdekken.

PROEFSCHRIFTEN

Partnerships

ARTROSE

International

AGEING

Excellence

EPIGENETICA

Excellence

BIO INFORMATICA

EPIGENETICA TEAM

prof.dr. Bas Heijmans

Professor Populatie Epigenomica

Laura Franken MSc

Research analist

Pia Todtenhaupt MSc

Onderzoeker in opleiding

Nathalie Reilly MSc

Onderzoeker in opleiding

Lucy Sinke MSc

Onderzoeker in opleiding

Koen Dekkers MSc

Onderzoeker in opleiding

Yunfeng Liu Msc

Onderzoeker in opleiding

MEEST RECENTE PUBLICATIES EPIGENETICA

Respiratory distress syndrome and bronchopulmonary dysplasia after fetal growth restriction: Lessons from a natural experiment in identical twins

Respiratory distress syndrome and bronchopulmonary dysplasia after fetal growth restriction: Lessons from a natural experiment in identical twins | February 2021 | E Clinical Medicine Sophie G.Groene, Jip A.Spekman, Arjan B.te Pas, Bastiaan T.Heijmans, Monique C.Haak, Jeanine M.M.van Klink, Arno A.W.Roest, Enrico Lopriore Abstract Background [...]

september 20th, 2021|Categories: Papers epigenetica, Papers epigenetica|

Het effect van genetica op epigenetica gepubliceerd in Nature Genetics – 6 september 2021

Nature Genetics | 6 september 2021 Het effect van genetica op epigenetica gepubliceerd in Nature Genetics Nature Genetics publiceerde deze week het resultaat van een grootschalige internationale studie naar de invloed van genetica op DNA methylatie, een essentiële epigenetische factor. Het was het resultaat [...]

september 10th, 2021|Categories: Nieuws, Papers epigenetica|

Genetics and epigenetics of repeat derepression in human disease

Peter Thijssen| 01-09-2016 | Genetics and epigenetics of repeat derepression in human disease A large part of the human genome consists of repetitive DNA. In this thesis two human diseases have been studied in which deregulation of repetitive DNA is a central feature: facioscapulohumeral [...]

juli 5th, 2021|Categories: Papers epigenetica|

Persistent epigenetic differences associated with prenatal exposure to famine in humans

Proc Natl Acad Sci USA | November 2009 Abstract Extensive epidemiologic studies have suggested that adult disease risk is associated with adverse environmental conditions early in development. Although the mechanisms behind these relationships are unclear, an involvement of epigenetic dysregulation has been hypothesized. [...]

juni 24th, 2021|Categories: Papers epigenetica|

Identification and systematic annotation of tissue-specific differentially methylated regions using the Illumina 450k array

Epigenetics & Chromatin | Volume 6 | article numebr 26 | 06 August 2013 Abstract DNA methylation has been recognized as a key mechanism in cell differentiation. Various studies have compared tissues to characterize epigenetically regulated genomic regions, but due to differences in [...]

juni 24th, 2021|Categories: Papers epigenetica|

VRAGEN OVER ONS ONDERZOEK?

STEL UW VRAAG
Ga naar de bovenkant