dr. Marian Beekman

Marian Beekman (1972) is opgeleid tot biomedisch wetenschapper en bestudeert de rol van genetische en fenotypische variatie in humane gezonde veroudering en langlevenheid. Haar onderzoek focuseert is op het identificeren van variatie in genomische regionen die bijdragen aan metabole gezondheid en langlevendheid, waar de variatie in genexpressie, DNA sequentie en methylatie tekenen zijn van interesse. De integratie van genetische data met een wijd scala aan omics data om te onderzoeken hoe genetische variatie kan bijdragen aan gezonde veroudering is een van de voornaamste doelstelling in haar onderzoek. Daarom combineert zij de grondige fenotypering van de participanten van de Leiden LangLeven Studie met de data analyse in de setting of moleculaire epidemiologie.

Vakgebieden:

• Genetica
• Familiaire studies
• Integratie van omics data

Voornaamste studie populatie:

Leiden LangLeven Studie:

• 644 negentigjarige broers en zussen van 421 families
• 1671 nakomelingen en 744 partners daarvan als controle populatie
  • DNA
  • RNA (PAXgene)
  • Urine (ochtendurine)
  • Plasma (EDTA, citraat)
  • Serum (gevast, niet-gevast)
• Illumina OmniExpress, 660W-quad SNP array
• In 220 negentigjarigen: Complete Genomics whole genome sequence
• Biocrates metabolomics platform
• LC-MS Lipidomics platform Netherlands Metabolomics Center, Leiden
• IgG glycosilatie platform Parasitologie, LUMC, Leiden
• 1H-NMR metabolomics platform Parasitologie, LUMC, Leiden

Promovendi begeleid:

Niels van den Berg, titel proefschrift: ‘Family matters: a genealogical inquiry into the familial component of longevity‘ in 2020
Erik van den Akker, titel proefschrift: ‘Computational biology in human aging – an omics data integration approach‘ in 2015
Joris Deelen, titel proefschrift: ‘Genetic and biomarker studies of human longevity‘ in 2014 (cum laude)
Willemijn Passoors, titel proefschrift: ‘Transcriptomic studies in human ageing and longevity‘ in 2013